Desta vez, Ratchet e Clank estão levando os perigosos criminosos Vendra e Nefting Prog para o Centro de Detenção de Vartax, mas a dupla consegue escapar da custódia dos heróis.
Durante a fuga, os heróis acabam perdidos em um setor abandonado no fim da galáxia, no planeta Yerek. Lá, eles percebem uma crise interdimensional que representa grande ameaça ao universo - e será necessário escolher qual é a prioridade da dupla.
O estúdio promete diversas novidades de jogabilidade, incluindo desafios em que Clank pode alterar a gravidade, manipular objetos e resolver quebra-cabeças.